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PCR/RT-PCR 实验指南

基础分子生物学·3-5小时

普通 PCR 和逆转录 PCR 的标准操作流程,包括引物设计原则和常见问题排查。

1实验步骤

  1. 1引物设计:使用专业软件(如 Primer Premier 5)设计,长度 18-25bp,GC 含量 40-60%,避免连续 4 个相同碱基
  2. 2RNA 提取:使用 Trizol 或商品化 RNA 提取试剂盒,收集细胞或组织
  3. 3逆转录:使用逆转录酶和 Oligo(dT) 或随机引物,反应体系:RNA 1μg,逆转录酶 1μL,dNTP 2μL,缓冲液 4μL,RNase Free 水补至 20μL
  4. 4逆转录程序:25℃ 5分钟,42℃ 50分钟,70℃ 15分钟
  5. 5PCR 体系:模板 cDNA 2μL,上下游引物各 1μL,2× Master Mix 12.5μL,灭菌水补至 25μL
  6. 6PCR 程序:94℃ 3分钟预变性;94℃ 30秒,55-60℃ 30秒(根据引物 Tm 值调整),72℃ 30秒/1kb,循环 30-35 次;72℃ 5分钟延伸
  7. 7电泳检测:1.5% 琼脂糖凝胶,100V 电泳 30 分钟,EB 或替代染料染色
  8. 8成像:凝胶成像系统拍照,分析条带大小和亮度

注意事项

  • RNA 操作需使用 RNase Free 耗材和试剂
  • 引物设计避免 3' 端连续 G 或 C,超过 3 个会不稳定
  • 退火温度可根据 Tm 值计算,一般比 Tm 低 5℃
  • 阳性对照和阴性对照(NTC)必不可少
  • 出现非特异性条带时可提高退火温度或降低引物浓度