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应用与场景

按实验类型查找资料和工具

实验流程

公共工具

采购支持

实验支持实验方案产品目录

常用实验场景

Western Blot 应用场景
蛋白表达检测与验证

Western Blot

验证蛋白表达、分子量、修饰状态和处理组差异。

样本裂解与定量电泳与转膜封闭与抗体孵育
ELISA 应用场景
酶联免疫吸附试验

ELISA

定量检测血清、血浆、细胞上清和组织匀浆样本。

确认检测指标选择试剂盒类型样本与标准曲线
流式细胞术 应用场景
单细胞多参数分析

流式细胞术

分析免疫分型、细胞周期、凋亡、胞内因子和分选前样本。

样本制备与计数Panel 与荧光搭配染色与对照设置
分子生物学 应用场景
核酸扩增、克隆与表达验证

分子生物学

提取核酸、完成 PCR/qPCR 与反转录，开展克隆构建和表达验证。

样本与核酸提取PCR/qPCR 体系设计克隆、转染或构建

全部实验类型

蛋白与免疫检测

Western Blot 场景图
蛋白表达检测与验证

Western Blot

验证蛋白表达、分子量、修饰状态和处理组差异。

ELISA 场景图
酶联免疫吸附试验

ELISA

定量检测血清、血浆、细胞上清和组织匀浆样本。

ELISpot / FluoroSpot 场景图
单细胞分泌功能检测

ELISpot / FluoroSpot

检测抗原特异性 T 细胞、B 细胞和细胞因子分泌细胞频率。

IHC / 免疫组化 场景图
组织定位与表达评估

IHC / 免疫组化

在 FFPE 与冰冻切片中定位并观察蛋白表达。

免疫荧光 场景图
荧光定位与共定位成像

免疫荧光

观察细胞、冰冻切片和部分 FFPE 样本中的荧光定位。

细胞分析

免疫磁珠分选 / 细胞分离 场景图
细胞富集、去除与 untouched 分离

免疫磁珠分选 / 细胞分离

在流式、FACS、单细胞建库和 ELISpot 前富集或去除目标细胞。

流式细胞术 场景图
单细胞多参数分析

流式细胞术

分析免疫分型、细胞周期、凋亡、胞内因子和分选前样本。

单细胞组学 场景图
单细胞测序与细胞图谱

单细胞组学

检查单细胞悬液质量、细胞富集和建库前质控。

细胞外囊泡研究 场景图
EV / 外泌体分离与表征

细胞外囊泡研究

明确囊泡来源、完成分离富集，测定粒径浓度并验证 marker。

空间与成像

空间生物学 场景图
空间转录组与空间蛋白组

空间生物学

制备组织切片、完成空间定位与多重染色，进行图像配准。

小动物实验与成像 场景图
动物模型、活体成像与数据定量

小动物实验与成像

围绕动物模型、探针给药、麻醉监测、图像采集和定量分析组织材料与流程。

模型与培养

类器官与 3D 细胞培养 场景图
三维模型与疾病模拟

类器官与 3D 细胞培养

配置 ECM、培养体系和生长因子，管理传代、冻存和药筛读数。

基因功能与组学

CRISPR 基因编辑 场景图
基因功能与编辑验证

CRISPR 基因编辑

设计 sgRNA，安排编辑递送、筛选富集、基因型鉴定和功能验证。

蛋白组学与质谱分析 场景图
蛋白组、修饰组与靶向验证

蛋白组学与质谱分析

准备样本，完成酶解、标记、LC-MS 数据分析和候选蛋白验证。

分子生物学

分子生物学 场景图
核酸扩增、克隆与表达验证

分子生物学

提取核酸、完成 PCR/qPCR 与反转录，开展克隆构建和表达验证。

公共工具与分析软件

条带定量

ImageJ/Fiji免费开源 ImageJ 发行版，适合 WB 条带灰度、背景扣除、ROI 和批量图像处理。

Western Blot

站内计算器

ELISA 曲线拟合计算器站内免费工具，支持标准品 OD 4PL 拟合、样本浓度回算、质控提示和结果导出。

ELISA

组织图像分析

QuPath免费开源数字病理与组织图像分析工具，适合 IHC 切片标注、细胞检测和半定量分析。

IHC / 免疫组化

细胞图像分析

CellProfiler免费开源细胞图像分析软件，适合细胞分割、批量定量和可复用 pipeline。

免疫荧光

免疫数据资源

ImmPort免疫学公共数据资源，可查阅免疫功能实验相关数据和研究条目。

ELISpot / FluoroSpot

抗原和表位资源

IEDB免疫表位数据库，可用于查询抗原肽、表位和免疫应答资料。

ELISpot / FluoroSpot

IEDB Analysis Resource表位预测和免疫原性分析工具，可辅助筛选候选抗原肽和设计刺激条件。

ELISpot / FluoroSpot

流式数据资源

FlowRepository公共流式细胞术数据仓库，可查阅免疫表型、分选验证和细胞功能实验关联数据。

ELISpot / FluoroSpot

细胞 marker 参考

CellMarker公共细胞 marker 数据库，可辅助选择目标细胞和去除细胞 marker。

免疫磁珠分选 / 细胞分离

PanglaoDB单细胞 marker 和细胞类型参考数据库，可辅助确认富集目标。

免疫磁珠分选 / 细胞分离

公共细胞图谱

Human Cell Atlas公共细胞图谱项目，可辅助理解组织细胞组成和目标群体。

免疫磁珠分选 / 细胞分离

CELLxGENE Discover公共单细胞数据门户，可浏览、检索和下载已发布细胞图谱数据。

单细胞组学

UCSC Cell Browser用于浏览单细胞数据集、细胞注释和表达模式的公共资源。

单细胞组学

Single Cell PortalBroad Institute 提供的单细胞数据浏览和共享平台。

单细胞组学

FCS 数据分析

Cytoflow 分析软件（用户手册）免费开源流式数据分析软件文档，了解 GUI、workflow 复用、元数据分组和数据分析流程。

流式细胞术

Cytoflow 官方下载前往 Cytoflow 官网获取免费开源软件安装包与版本更新。

流式细胞术

单细胞分析

Scanpy免费开源 Python 单细胞分析工具，适合质控、聚类、注释和可视化。

单细胞组学

Seurat免费开源 R 单细胞分析工具，适合 scRNA-seq、多模态数据和可视化分析。

单细胞组学

scvi-tools免费开源单细胞深度生成模型工具集，适合批次校正和多样本比较。

单细胞组学

细胞注释

Azimuth基于参考图谱的细胞注释工具，可辅助快速映射和初步解释。

单细胞组学

空间组学分析

Squidpy免费开源空间组学分析工具，可用于空间邻域、表达模式和图像特征分析。

空间生物学

Giotto免费开源空间转录组分析框架，支持空间网络、细胞邻域和可视化。

空间生物学

Seurat spatialSeurat 的空间数据分析流程，适合配合单细胞注释使用。

空间生物学

stLearn免费开源空间转录组分析工具，结合形态图像和空间表达信息。

空间生物学

图像与 ROI

napari免费开源多维图像查看器，适合大图、切片和多通道图像检查。

空间生物学

图像数据管理

OME-Zarr开放显微图像数据格式规范，适合大规模空间图像数据管理。

空间生物学

OMERO开源显微图像数据管理平台，适合团队管理、标注和共享图像数据。

类器官与 3D 细胞培养

三维影像

3D Slicer免费开源医学图像平台，可处理 CT、MRI、PET 等三维数据和分割任务。

小动物实验与成像

ITK-SNAP常用医学图像分割工具，适合结构影像 ROI 标注和体积分析。

小动物实验与成像

图像数据

BioImage Archive公共生物图像数据归档资源，可查阅参考图像数据集和共享规范。

类器官与 3D 细胞培养

类器官分析

OrganoidTracker开源类器官谱系和细胞追踪工具，适合特定 3D 成像分析场景。

类器官与 3D 细胞培养

sgRNA 设计

CHOPCHOP公共 CRISPR sgRNA 设计工具，可用于多物种基因编辑靶点设计。

CRISPR 基因编辑

CRISPORCRISPR sgRNA 设计和脱靶评分资源，适合候选靶点比较。

CRISPR 基因编辑

脱靶评估

Cas-OFFinder用于搜索 CRISPR/Cas 潜在脱靶位点的公共工具。

CRISPR 基因编辑

编辑结果分析

CRISPResso2免费开源 CRISPR 测序结果分析工具，可评估 indel 和编辑效率。

CRISPR 基因编辑

实验参考

Addgene CRISPR Guide非营利质粒资源平台提供的 CRISPR 实验设计与载体参考。

CRISPR 基因编辑

EV 规范与记录

EV-TRACKEV 实验方法透明度和记录规范资源，用于整理分离和表征信息。

细胞外囊泡研究

MISEV Guidelines国际细胞外囊泡研究学会发布的 EV 研究建议和报告规范入口。

细胞外囊泡研究

EV 数据库

ExoCarta细胞外囊泡蛋白、RNA 和脂质条目的公共数据库。

细胞外囊泡研究

Vesiclepedia收录 EV 分子组成和研究条目的公共数据库。

细胞外囊泡研究

公共数据归档

PRIDE Archive公共蛋白组学数据归档资源，可用于检索和提交质谱数据。

蛋白组学与质谱分析

ProteomeXchange蛋白组学公共数据交换联盟入口，适合查找归档数据集。

蛋白组学与质谱分析

蛋白数据库

UniProt蛋白序列、功能注释和交叉引用数据库，是质谱解释常用参考。

蛋白组学与质谱分析

质谱数据分析

MaxQuant常用蛋白组学数据分析软件，可用于谱图检索和定量分析。

蛋白组学与质谱分析

FragPipe免费开放的质谱数据分析软件，包含 MSFragger 等工具。

蛋白组学与质谱分析

靶向质谱验证

Skyline免费开源靶向质谱方法开发和数据分析软件，适合 PRM/SRM 验证。

蛋白组学与质谱分析

引物设计

PrimerBank查询已整理的人/鼠 qPCR 引物，适合基因表达定量项目快速初筛。

分子生物学

NCBI Primer-BLAST设计 PCR/qPCR 引物并用 BLAST 检查特异性，适合新靶标引物设计。

分子生物学

Primer3经典公共引物设计工具，可自定义产物长度、Tm、GC 和引物参数。

分子生物学

引物检查

UCSC In-Silico PCR输入引物后在基因组中模拟扩增，用于确认扩增位置和潜在非特异产物。

分子生物学

序列查询

NCBI Gene查询基因 ID、别名、RefSeq 转录本、物种注释和基础功能信息。

分子生物学

NCBI BLAST比对引物、PCR 产物、插入片段或测序结果，检查同源性和特异性。

分子生物学

克隆构建

Addgene Vector Database非营利质粒库提供的常用载体信息，可辅助查询骨架、抗性、启动子和表达系统。

分子生物学

Sequence Manipulation Suite免费开源序列处理工具集合，可做反向互补、翻译、限制性位点和基础序列分析。

分子生物学

RNA 调控与靶标

ENCORI / starBase查询 miRNA、lncRNA、circRNA、mRNA 与 RBP 互作，支持 ceRNA 网络和泛癌分析。

分子生物学

TargetScanmiRNA 靶基因预测数据库，适合候选靶标初筛和保守性判断。

分子生物学

miRDBmiRNA 靶基因预测资源，可与 TargetScan、ENCORI 等交叉验证候选靶点。

分子生物学

miRTarBase收录实验验证的 miRNA-target 互作，适合查找证据等级更强的靶标关系。

分子生物学

RNAcentral非编码 RNA 综合序列与注释资源，适合查询 miRNA、lncRNA 等 RNA 条目。

分子生物学

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支持 Cytoflow 维护者 LeahCytoflow 为免费开源软件；如该工具对您的数据分析有帮助，可通过 Ko-fi 支持维护者继续改进。

流式细胞术